Нашим поставщиком была создана, а затем отозвана и повторно выгружена в тот же день (17 07 19) накладная. Номер корректной выгруженной в ЕГАИС накладной TTN-***. Номер фиксации WBF-***. Но в 1с загрузилась только первая (отмененная). Как получить корректную?

Причина возникновения проблемы — одинаковый номер и дата входящего документа (это единственный возможный вариант идентификации документа, поэтому такие проблемы, к сожалению, случаются). Из-за чего при загрузке для второго документа не удалось определить уникальный идентификатор.
Для решения проблемы нужно в регистре «Загруженные документы УТМ ЕГАИС» найти полученный, но не загруженный документ по входящему номеру (эти данные можно получить у поставщика).
Дважды щелкнуть по найденной строке. В открывшейся форме указать корректный идентификатор ТТН и проверить отсутствие установленного флага «Загружен». Затем нажать кнопку «Записать и закрыть».
Теперь документ доступен для загрузки из обработки «Загрузка документов из УТМ».